明治维新之后，
土御门神道被视为“淫祀邪教”而废止，
国家神道机构在战后也由向公家服务转为民间组织。
显赫一时的土御门家族没落。而同时，
在暗中的藤原家仍然掌管着日本国家阴阳师的命脉。
2013年，土御门家后继者土御门克已突然现身，
封印京都灵所，控制了多家神社的祭神。
藤原属下的里御所与土御门家双方在夜之京都
进行着式神之间的战斗，导致了京都各势力的反感。
其中，以佛教密宗，律宗为代表，
僧众们要求镇压阴阳师的战争，展开了会议。
并邀请大慈寺的律宗法师前往参与法会。
在不明真相的情况下，武元婴与陆心岚踏上了
危机重重，吉凶未知的旅程。